More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2325 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  100 
 
 		 316 aa  644    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  29.33 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2765  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  28.52 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  28.15 
 
 		 320 aa  92.4  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  26.43 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  28.16 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000419  universal stress protein family 1  26.72 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  27.78 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1119  hypothetical protein  32.14 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  30.81 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  30.66 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  28.44 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  32.64 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  28.52 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  29.44 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2285  hypothetical protein  25.56 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2271  UspA domain-containing protein  31.28 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2449  hypothetical protein  30.81 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2306  hypothetical protein  31.46 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  27.27 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.47 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0566  hypothetical protein  27.96 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  25.39 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  28.9 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  24.58 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  29.49 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  28.9 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  25.08 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  26.86 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  27.44 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  30.23 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  27.31 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.18 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.84 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.79 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.64 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.14 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  20.69 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  27.36 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  26.94 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  25.09 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  28.31 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  26.79 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  26.79 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.5 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  24.35 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  26.43 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  29.03 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  25.55 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.24 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  26.09 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  29.93 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  26.32 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  29.25 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.97 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  24.48 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.57 
 
 		 151 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  26.9 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  26.81 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  24.66 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  27.76 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.47 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  25.99 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  25.82 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  24.46 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  26.43 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1615  UspA domain protein  27.08 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  24.1 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  26.71 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.89 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  28.97 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1649  UspA domain-containing protein  26.27 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03146  Universal stress protein, UspA  25.65 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  29.74 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.34 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  25.5 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  27.8 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  31.47 
 
 		 164 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  27.5 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  23.26 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  29.8 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0834  UspA domain protein  26.5 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.652975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  25.96 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.64 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  24.53 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  24.88 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  23.97 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  27.06 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  23.97 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  23.97 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  23.97 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  26.9 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  28.85 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>