More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0850 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  566  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  51.41 
 
 
284 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  53.17 
 
 
283 aa  288  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  48.42 
 
 
281 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  45.04 
 
 
281 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  43.32 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  44.33 
 
 
281 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  45.77 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  39.79 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  38.73 
 
 
283 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  39.22 
 
 
287 aa  215  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  39.22 
 
 
287 aa  215  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  39.22 
 
 
287 aa  215  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 
284 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  37.85 
 
 
283 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 
283 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 
285 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 
284 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 
283 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 
284 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
284 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  37.54 
 
 
284 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  37.19 
 
 
284 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  34.15 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  38.46 
 
 
283 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  35.25 
 
 
288 aa  168  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 
288 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  31.96 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  32.97 
 
 
287 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  32.75 
 
 
281 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  32.51 
 
 
286 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
307 aa  145  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  26.15 
 
 
284 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  24.3 
 
 
278 aa  105  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  25.8 
 
 
284 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  25.87 
 
 
281 aa  99  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  24.3 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  30.42 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  19.79 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  31.14 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  37.04 
 
 
126 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.62 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  27.71 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  26.64 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  26.64 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.78 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.33 
 
 
138 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.04 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
128 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  35.04 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  27.78 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  26.11 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  26.3 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  28.95 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.71 
 
 
180 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.56 
 
 
155 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  27.06 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  26.61 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  27.63 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.2 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  30.4 
 
 
157 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  32.57 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  29.63 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  24.92 
 
 
297 aa  59.3  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  30.41 
 
 
276 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.71 
 
 
277 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  25.19 
 
 
152 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  31.78 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  26.45 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  25.74 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
128 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  28.9 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  24.23 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  22.71 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  24.51 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  32.54 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.68 
 
 
150 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  23.91 
 
 
317 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.37 
 
 
300 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  30.36 
 
 
271 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  23.49 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
140 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  29.69 
 
 
136 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  28.09 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.97 
 
 
156 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.33 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  25 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.53 
 
 
159 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  27.55 
 
 
306 aa  53.5  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  24.41 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  28.9 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  29.89 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  25 
 
 
296 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>