251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1994 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  583  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  583  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  89.44 
 
 		 284 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  81.34 
 
 		 285 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  60.21 
 
 		 283 aa  351  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  58.25 
 
 		 284 aa  320  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  49.65 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 		 312 aa  269  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  46.13 
 
 		 281 aa  269  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  48.24 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  49.3 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  48.23 
 
 		 285 aa  256  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  51.06 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  46.32 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  48.94 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  46.32 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  39.22 
 
 		 287 aa  205  8e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  36.01 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  36.01 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  36.01 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  39.08 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 288 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  38.38 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  37.63 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  36.62 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  36.84 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  35.79 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  35.44 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  29.23 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  30.39 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  27.37 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  29.68 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  31.82 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  23.88 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  27.54 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  27.54 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  30.73 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  26.87 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  19.59 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  28.65 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  33.14 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.84 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  26.99 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  27.72 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  28.95 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  32.88 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30.67 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  30.67 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  31.79 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  27.12 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  31.33 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  28.83 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  32.22 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  33.04 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  30.39 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  31.29 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  25.97 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  29.69 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  30.9 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  29.21 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  31.13 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  29.31 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  25.73 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  28.02 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  29.44 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  29.44 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  29.44 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  29.44 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  29.21 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  28 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  25.31 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  25.4 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  29.66 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  28.33 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  26.34 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  28.86 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  24.37 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  26.97 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  29.94 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  26.16 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.41 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  25.14 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 		 128 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  26.7 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  29.76 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>