207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2567 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  85.56 
 
 		 270 aa  434  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  65.56 
 
 		 313 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  65.56 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  61.87 
 
 		 278 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  57.78 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  60.89 
 
 		 271 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  56.41 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  53.51 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  52.77 
 
 		 271 aa  262  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  51.29 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  50.18 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  50.18 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  50.92 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  41.18 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  40.57 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  44.72 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  40.81 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  44.04 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  43.32 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  44.04 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  43.68 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  40.78 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  42.61 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  36.96 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  37.18 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  39.15 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  36.46 
 
 		 274 aa  155  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  33.94 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  34.53 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  34.16 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  34.18 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  35 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  33.45 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  31.43 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  33.57 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  33.57 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  34.77 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  33.33 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  34.51 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  33.22 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  33.22 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  33.22 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  33.22 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  33.22 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  33.22 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  33.69 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.39 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  33.45 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  35.98 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  32.27 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  33.21 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  34.04 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  32.99 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  32.74 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.95 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  33.21 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  31.6 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  38.21 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  37.5 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  38.71 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  41.48 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  30.99 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  31.21 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  33.11 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  32.62 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  33.92 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  32.53 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  32.76 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  39.57 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  32.26 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  36.67 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  31.56 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  32.51 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  31.56 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  30.8 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  28.98 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  37.61 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  37.56 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  36.02 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  33.21 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  33.33 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  33.33 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  33.33 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  29.58 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  42.66 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  35.59 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>