179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1913 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  57.4 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  54.68 
 
 		 274 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  55 
 
 		 278 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  54.12 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  52.88 
 
 		 276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  37.28 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  35.13 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  35.74 
 
 		 275 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  34.77 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  37.63 
 
 		 270 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  37.14 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  34.52 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  35.31 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  34.88 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  33.81 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  31.9 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  30.58 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  32.98 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  32.04 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  32.04 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  33.22 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  32.38 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  32.03 
 
 		 270 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  31.07 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  32.74 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  31.83 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  31.79 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  31.83 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  28.67 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.75 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  32.19 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  32.19 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  32.19 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  32.19 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  32.19 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  32.19 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  28.07 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  32.19 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  28.77 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  28.77 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  28.77 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  28.77 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  30.18 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  30.36 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  28.77 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  30.6 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  27.97 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  27.82 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  30.96 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  29.85 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  37.22 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  29.43 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  27.11 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  28.12 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  26.33 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  30.42 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  29.51 
 
 		 277 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  29.26 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  27.72 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  29.67 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  26.06 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  27.6 
 
 		 264 aa  85.9  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  33.52 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  30.99 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  34.87 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  29.64 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  30 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30.18 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  37.99 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  34.24 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  27.34 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  31.25 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  29.27 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  28.28 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  29.31 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  28.47 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  32.58 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2982  UspA domain-containing protein  29.74 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  33.69 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>