168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2574 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  543  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  80.15 
 
 		 274 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  58.11 
 
 		 268 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  55.64 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2564  universal stress protein, UspA  41.18 
 
 		 189 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  33.33 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  30.98 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  31.28 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  31.28 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  33.18 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  29.78 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  28.16 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  30.12 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  29.55 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  33.17 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  29.88 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  31.36 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  29.85 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  31.31 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  29.89 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  33.8 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  29.89 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  29.89 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  29.89 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  29.89 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  29.89 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  28.67 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  30.12 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  29.97 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  31.96 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  29.6 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  35.56 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  27.64 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  27.64 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  30.4 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  28.01 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  31.78 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  31.66 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  32.85 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  31.31 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  35.14 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.52 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.52 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.52 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.52 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  33.11 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  30.58 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  36.42 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  26.22 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  33.11 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  32.54 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  30.99 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  28.84 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  33.91 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  29.07 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  33.56 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  32.18 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  34.58 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  34.58 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  26.13 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  28.47 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  33.11 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  29.07 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  33.93 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  32.79 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  36.97 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  27 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  27.84 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  29.2 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  36.97 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  33.33 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  37.19 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  32.39 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  31.15 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  32.8 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  27.85 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  27.92 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  31.44 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  31.25 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  27.49 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  32.39 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>