246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2231 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  33.68 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  33.1 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  34.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  34.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  34.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  34.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 
277 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  34.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  34.14 
 
 
279 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  34.01 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  32.86 
 
 
282 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
282 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
279 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.87 
 
 
281 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  30.58 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 
279 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  27.24 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  37.57 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  31.32 
 
 
274 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  37.41 
 
 
276 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  36.16 
 
 
279 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  33.33 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  36.42 
 
 
280 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  31.95 
 
 
279 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  31.95 
 
 
279 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  28.08 
 
 
265 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  32.27 
 
 
278 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  31.23 
 
 
280 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 
276 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  31.47 
 
 
278 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 
280 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
279 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  38.86 
 
 
311 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  33.85 
 
 
282 aa  105  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  33.21 
 
 
270 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  31.01 
 
 
270 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
279 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
286 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  39.49 
 
 
286 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  32.56 
 
 
277 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
313 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  28.77 
 
 
278 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  39.49 
 
 
286 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  37.89 
 
 
281 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
279 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  30 
 
 
278 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  31.93 
 
 
278 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  31.93 
 
 
278 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  30.71 
 
 
280 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  38.46 
 
 
286 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  31.93 
 
 
279 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  31.93 
 
 
279 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  30.51 
 
 
279 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  38.62 
 
 
276 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  32.04 
 
 
270 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  37.67 
 
 
280 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
271 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  29.6 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  34.66 
 
 
277 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  34.66 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  39.04 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  39.13 
 
 
281 aa  99.4  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  39.13 
 
 
281 aa  99.4  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 
286 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  36.26 
 
 
279 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.27 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  28.38 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  29.23 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  27.82 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  33.96 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  34.83 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  32.71 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  28.32 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  35.87 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  35.59 
 
 
278 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
286 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  37.85 
 
 
286 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  37.16 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  39.73 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
270 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  28.68 
 
 
277 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  35.98 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  36.32 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  28.62 
 
 
279 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 
272 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  32.22 
 
 
279 aa  92  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  36.71 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  29.15 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  36.46 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  29.96 
 
 
287 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2974  UspA domain-containing protein  27.8 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  34.44 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  30.59 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  33.89 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.459492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>