243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1849 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  564  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  55.52 
 
 		 282 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  55.87 
 
 		 282 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  55.87 
 
 		 282 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  52.5 
 
 		 279 aa  279  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  34.98 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.54 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  37.71 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  33.22 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  33.22 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  33.69 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  33.22 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  33.22 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  33.22 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  33.22 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  31.83 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  36.57 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.29 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  30.9 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.76 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  31.51 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  39.89 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  39.89 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  39.89 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  36.78 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  39.89 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  36.51 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  39.34 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  32.65 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  35.63 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  29.07 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  29.07 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  38.15 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  35.56 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  31.48 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  30.24 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2974  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  29.68 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  27.07 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  38.76 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  36.63 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  34.81 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  37.57 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  30.86 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  36.52 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  39.08 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  35.6 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  31.07 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  36.52 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  40 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  33.85 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  29.68 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1679  hypothetical protein  30.19 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0785159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  42.53 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  26.64 
 
 		 281 aa  95.9  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  36 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  34.43 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  31.7 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  35.87 
 
 		 313 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  31.65 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  35.68 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  35.06 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  35.35 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  36.63 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  36.67 
 
 		 270 aa  92  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  34.68 
 
 		 274 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  31.65 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  37.22 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  31.89 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1046  UspA domain protein  38.41 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  32.42 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  29.83 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  35.43 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  37.01 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  36.36 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  37.71 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 286 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  35.1 
 
 		 265 aa  89  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  25.87 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  35.1 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  32.57 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  35.63 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  35.26 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>