235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0427 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  92.62 
 
 		 271 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  69 
 
 		 271 aa  350  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  55.51 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  56.46 
 
 		 271 aa  271  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  52.77 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  52.03 
 
 		 270 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  49.82 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  52.03 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  52.4 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  51.29 
 
 		 271 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  51.61 
 
 		 278 aa  241  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  52.03 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  51.66 
 
 		 271 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  45.26 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  47.67 
 
 		 270 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  44.89 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  47.67 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  45.42 
 
 		 270 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  44.96 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  43.84 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  42.81 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  46.64 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  46.29 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  46.52 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  38.27 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  36.96 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  39.08 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  37.81 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  36.65 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  38.73 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  35.87 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  37.63 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  34.77 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  36.52 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  36.52 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  35.84 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  36.75 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  34.63 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  34.52 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  34.15 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  30.58 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  34.48 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  33.33 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  33.33 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  33.33 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  33.33 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  33.33 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  35.19 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  34.15 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  34.77 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  32.97 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  35.38 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  42.19 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  43.26 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.58 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  33.69 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  35.31 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 315 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  33.46 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  32.99 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  31.91 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  32.31 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  29.82 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.62 
 
 		 291 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  39.89 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  36.67 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  41.01 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  31.58 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  31.69 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  34.05 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  40.78 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  40.45 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  32.14 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  36 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  32.39 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  37.91 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  32.98 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  34.51 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  38.29 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  30.98 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  34.27 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  37.79 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  31.9 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  35.32 
 
 		 280 aa  98.6  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  37.85 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>