250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1300 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  100 
 
 		 278 aa  551  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  82.01 
 
 		 313 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  82.01 
 
 		 270 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  61.87 
 
 		 270 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  57.55 
 
 		 270 aa  289  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  61.15 
 
 		 270 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  56.99 
 
 		 271 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  56.99 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  52.48 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  51.61 
 
 		 271 aa  241  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  50.18 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  50.9 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  48.39 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  49.11 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  42.2 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  42.91 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  42.91 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  44.17 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  41.49 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  43.01 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  43.21 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  42.51 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  38.3 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  37.72 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  34.98 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  35.44 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  34.63 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  36.55 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  36.55 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  36.55 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  36.55 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  36.55 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  36.55 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  36.55 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  32.73 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  30.99 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  36.64 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  33.45 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  34.29 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  35 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  34.03 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  32.76 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  35.49 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  35.29 
 
 		 278 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  32.3 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  37.21 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  35.35 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  40.22 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  30.8 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  30.8 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  32.4 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.8 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  31.94 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  33.79 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  31.69 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  37.61 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  35.29 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  31.58 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  31.84 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  37.61 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  28.77 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  32.52 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  31.83 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.69 
 
 		 278 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.69 
 
 		 278 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.69 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.69 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  40.66 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  40.66 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  39.04 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  37.71 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  35.86 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  29.93 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  37.36 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  39.04 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 286 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  42.47 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  38.5 
 
 		 286 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  31.6 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  30.2 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  35.87 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  30.34 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  42.95 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  37.16 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>