260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0185 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  563  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  74.55 
 
 		 279 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  74.55 
 
 		 279 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  51.25 
 
 		 278 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  44.72 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  44.25 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 279 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  42.5 
 
 		 279 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  42.14 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  42.14 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  42.14 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  42.14 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  42.14 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  42.14 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  42.14 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  42.5 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  42.2 
 
 		 279 aa  214  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  41.43 
 
 		 279 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  40.99 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  39.43 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  42.05 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  37.99 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  40.42 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  41.11 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  40.56 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  39.93 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  34.88 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  39.29 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  35.56 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  35.56 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  35.56 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  35.56 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  39.16 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  38.28 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  37.37 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  35.54 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  33.1 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  32.97 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  36.93 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 		 272 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  36.59 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  35.94 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  31.51 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  34.39 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  31.77 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  38.2 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  35.34 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  34.51 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  31.65 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  36.75 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.16 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  35.11 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  33.22 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  36.4 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  34.28 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  34.28 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  32.16 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  30.74 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  40.78 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  32.98 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  37.81 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  32.28 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  32.76 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  31.34 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  34.6 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  31.18 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  33.57 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  32.51 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  31.9 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  30.69 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  40.72 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  32.87 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  40.72 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  39.18 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  34.26 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  32.5 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  35.84 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  37.44 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  34.93 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  30.88 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  31.25 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  31.91 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  31.12 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  28.12 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>