192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0440 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  89.71 
 
 		 272 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  52.21 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  49.63 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  47.46 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  46.69 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  46.76 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  49.45 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  42.81 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  44.24 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  42.29 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  39.71 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  40.36 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  43.32 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  42.96 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  41.54 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  41.97 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  41.61 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  39.3 
 
 		 275 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  42.2 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  40.78 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  41.91 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 		 271 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  41.91 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  35.48 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  36.69 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  37.14 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  38.52 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  35.31 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  37.5 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  37.23 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  35.74 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  34.15 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  34.77 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  34.17 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  34.98 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  34.98 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  33.45 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  35.92 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.57 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.28 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  32.86 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  31.39 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  34.21 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.93 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  29.01 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.03 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.03 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.03 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.03 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.59 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  30.11 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  34.21 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  30.6 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  28.11 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  31.93 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  29.12 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  32.17 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  33.22 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  30.16 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  40.11 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  27.05 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  32.01 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  31.36 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  33.99 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  31.49 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  39.66 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  36.16 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  34.74 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  33.01 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  36.05 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  34.48 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  40.33 
 
 		 286 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  33.51 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  33.18 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  37.67 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  30.12 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  35.68 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  32.98 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  38.62 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  36.72 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  35.8 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  32.54 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  36.99 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>