237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2353 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  44.6 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  45.68 
 
 		 274 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  40.65 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  41.43 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  40.29 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  39.93 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  39.22 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  38.65 
 
 		 277 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  38.3 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  38.99 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  39.13 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  42.75 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  34.53 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  34.75 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  36.65 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  36.65 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  35.48 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  36.17 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.52 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  35.66 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  34.28 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  34.83 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  34.86 
 
 		 280 aa  138  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  34.64 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  34.75 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  32.97 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  35.71 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  35.71 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  35.71 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  35.71 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  34.4 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  34.4 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  34.4 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  34.4 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  34.4 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  34.4 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  35.36 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  33.45 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  34.29 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  29.72 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  37.94 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  33.33 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  35.51 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  34.36 
 
 		 242 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  44.07 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  34.16 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  34.41 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  34.51 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  36.04 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.62 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  33.96 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  31 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  34.15 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  36.4 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  32.81 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  32.81 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  32.87 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  32.52 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  36.04 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  34.63 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  35.34 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  36.1 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  34.5 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  36.55 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  33.69 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  34.06 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  42.93 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  30.36 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  35.34 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  38.5 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  35.98 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  36.07 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  34.97 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  31.14 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  33.62 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  36.43 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  39.8 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  35.13 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  39.8 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  35.2 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>