278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6103 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  63.1 
 
 		 271 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  42.75 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  41.52 
 
 		 274 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  40.29 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  41.55 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  42.4 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  39.13 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  39.11 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  40.45 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  39.13 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  47.16 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  36.23 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  36.68 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  37.64 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  40.89 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  40.82 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  46.59 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  37.02 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  39.92 
 
 		 278 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  43.5 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  37.84 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  41.35 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  36 
 
 		 280 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  38.95 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  36.8 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  37.25 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  44.13 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  36.8 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  38.4 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  36.8 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  36.8 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  36.8 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  36.8 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  36.8 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  44.44 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  44.32 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  39.27 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  43.01 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  43.01 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  43.01 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  43.01 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  43.18 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  39.92 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  43.65 
 
 		 278 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  40.34 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  43.86 
 
 		 308 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  35.29 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  43.43 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  40.91 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  40.91 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  45.71 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 286 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  33.45 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  37.37 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  42.53 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  38.19 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  39.23 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  34.2 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  41.81 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  36.79 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  36.56 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  35.75 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  36.82 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  36.2 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  38.43 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  36.45 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  36.82 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  44.78 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  36.12 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  34.51 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  37.44 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  31.58 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  41.24 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  40.78 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  39.13 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  40.39 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  41.14 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  41.09 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  39.77 
 
 		 278 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  32.88 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  35.43 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  41.81 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  35.23 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  32.74 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>