201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0400 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  45.09 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  41.14 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  32.42 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  38.03 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  34.69 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  35.58 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  30.08 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  32.94 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  33.84 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  36.57 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  45.64 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  31.45 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  39.77 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  32.65 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  34.7 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  36.78 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  35.44 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  41.21 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  39.05 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  34.33 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  33.84 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  33.45 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  34.86 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  37.71 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  35.59 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  39.88 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  34.63 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  39.66 
 
 		 273 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.86 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  38.07 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  33.18 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  40.56 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  36.57 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  38.56 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  36.16 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  29.43 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  33.19 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  36.52 
 
 		 286 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 		 277 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  35.87 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  35.42 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  35.9 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  36.72 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  37.29 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  31.25 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  36.16 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  36.52 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  36.16 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  34.46 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  34.46 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  36.16 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  36.16 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  36.16 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  36.16 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1046  UspA domain protein  35.23 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308422  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  36.42 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  38.89 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  34.4 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  29.74 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  33.52 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  32.4 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  33.52 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  28.85 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  34.09 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  32.96 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  35.75 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  35 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  35 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  33.77 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  30.58 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  35 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  35 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  32.34 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  35.2 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  36.78 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  32.96 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  35.87 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  35.36 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  28.45 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  37.02 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  34.27 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  29.36 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  34.25 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  33.89 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  31.97 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>