219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4210 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  100 
 
 
280 aa  558  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  46.45 
 
 
281 aa  238  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  43.62 
 
 
291 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  37.72 
 
 
279 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  37.37 
 
 
278 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  37.14 
 
 
279 aa  148  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  34.4 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  32.23 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  40.41 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.78 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  37.79 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  37.79 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  31.69 
 
 
274 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  35.79 
 
 
274 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  40.56 
 
 
291 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  37.67 
 
 
242 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  38.95 
 
 
280 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  40 
 
 
281 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  37.08 
 
 
279 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  99  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  31.82 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  39.49 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
279 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  36.2 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  35.04 
 
 
282 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  31.96 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  31.96 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  36.04 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  31.96 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  31.96 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  31.96 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  31.96 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  35.75 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  35.22 
 
 
279 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  39.55 
 
 
286 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  36.87 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  38.42 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  36.05 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  37.06 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  35.06 
 
 
294 aa  92.4  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  37.7 
 
 
286 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  37.7 
 
 
286 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  39.6 
 
 
279 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  39.6 
 
 
279 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
276 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  32.39 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  40.94 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  32.26 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 
286 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  38.21 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  34.72 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  37.91 
 
 
311 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  35.5 
 
 
287 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 
279 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  35.39 
 
 
280 aa  89  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  37.91 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  36.12 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  39.6 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  36.76 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  31.98 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  35.08 
 
 
285 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  35.67 
 
 
308 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  30.82 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  38.51 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  35.15 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  36.12 
 
 
277 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  37.27 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  37.27 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  37.27 
 
 
279 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  37.27 
 
 
279 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  40.26 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  34.54 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.29 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  34.21 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  41.22 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  36 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  36.99 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  37.43 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  33.79 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  24.48 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  30.81 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  33.13 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  37.19 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>