185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3814 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  97.47 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  96.39 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  87.77 
 
 		 278 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  63.67 
 
 		 278 aa  341  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  60.43 
 
 		 278 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  58.84 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  61.51 
 
 		 279 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  61.51 
 
 		 279 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  61.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  61.51 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  57.35 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  59.21 
 
 		 275 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0756  universal stress protein  60.85 
 
 		 332 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  43.55 
 
 		 278 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  41.28 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  41.28 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  41.79 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  40.85 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  41.24 
 
 		 281 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  40.48 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  40.48 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  40.48 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  40.48 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  40.48 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  40.48 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  40.42 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  38.41 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  38.98 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  39.1 
 
 		 278 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  38.75 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  39.78 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  38.27 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  36.3 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  34.95 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  36.97 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  35.56 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  36.49 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  36.79 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  37.23 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  37.01 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  34.14 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  34.13 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  34.75 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  30.14 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  40.18 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  31.58 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  34.17 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  35.52 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  36.4 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  34.4 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  42.02 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  35.02 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  42.11 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  30.18 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  39.43 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  33.22 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  34.64 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  29.29 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  32.97 
 
 		 264 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  32.29 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  34.52 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  35.82 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  36.81 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  31.46 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  32.65 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  39.43 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  34.38 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  33.1 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  31.65 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  32.22 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  30.63 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  37.39 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  33.69 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  34.12 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  32.03 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  41.83 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  31.6 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  34.66 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  34.28 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  30.38 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  30.38 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.58 
 
 		 291 aa  98.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  31.03 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  38.16 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  32.18 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>