186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2305 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  615  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  63.93 
 
 		 279 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  50.7 
 
 		 280 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  39.79 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  39.86 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  39.86 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  38.03 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  39.86 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  39.86 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  36.75 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  36.75 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  36.14 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 277 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 277 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  37.5 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  37.54 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  35.99 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  35.49 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  35.49 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  35.49 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  35.49 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  35.49 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  35.49 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  36.79 
 
 		 277 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  35.48 
 
 		 276 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  36.84 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  35.76 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  36.41 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  47.22 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  34.47 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  33.33 
 
 		 270 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  30.66 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  31.69 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  33.1 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  35.92 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  32.63 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  42.07 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  36.79 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  30.85 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  38.92 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  36.21 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  29.55 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  33.8 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  32.53 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  32.51 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  40.79 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  34.95 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  42.79 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  43.02 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  37.78 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  38.97 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  32.04 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  32.06 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  36.44 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  38.61 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  31.27 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  37.69 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  29.82 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  40.41 
 
 		 287 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  32.97 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  33.98 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  33.98 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  28.32 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  31.6 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.25 
 
 		 280 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 		 272 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  39.73 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  39.89 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  30.47 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  32.58 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  30.56 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  33.33 
 
 		 242 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  39.04 
 
 		 272 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2982  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  30 
 
 		 270 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 		 287 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  34.47 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  32.51 
 
 		 265 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  30.54 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 270 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>