217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3269 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  78.6 
 
 		 271 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  55.35 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  51.66 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  51.66 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  54.24 
 
 		 271 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  49.82 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  50.92 
 
 		 270 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  48.71 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  49.45 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  51.09 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  50.72 
 
 		 313 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  49.11 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  49.1 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  49.1 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  50.92 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  45.22 
 
 		 272 aa  204  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  46.95 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  48.58 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  44.93 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  41.91 
 
 		 272 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  47.83 
 
 		 268 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  40.88 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  41.91 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  40.51 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  38.99 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  43.01 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  41.37 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  38.41 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  37.99 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  40.29 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  40.21 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  34.53 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  36.56 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  35.38 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  38.21 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  36.88 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  39.65 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  37.86 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  36.71 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  38.57 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  38.43 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  36.97 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  37.63 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  37.76 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  37.76 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  38.46 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  39.18 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  35.94 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  40.85 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  36.93 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  34.74 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  37.15 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  37.15 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  35.71 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  35.46 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  37.15 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  37.15 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  36.07 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  36.07 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  36.07 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  36.07 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  36.07 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  36.07 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  42.38 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  37.28 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  40.38 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  38.92 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  38.25 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  41.74 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  32.62 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  32.56 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  34.11 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  35.13 
 
 		 279 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  31.45 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  37.3 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  40.36 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  38.42 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.89 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  32.73 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  39.55 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  39.43 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  36.42 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  37.36 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  38.74 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  42.78 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  38.74 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  40.1 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  38.66 
 
 		 287 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  40.38 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  37.08 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  46.37 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>