205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2880 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  53.51 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  54.01 
 
 		 270 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  53.28 
 
 		 313 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  51.65 
 
 		 271 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  53.14 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  49.82 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  49.82 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  50.92 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  52.48 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  52.4 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  49.82 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  47.23 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  49.08 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  45.22 
 
 		 270 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  44.85 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  41.18 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  42.96 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  40.81 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  42.65 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  44.12 
 
 		 269 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  40.44 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 		 272 aa  175  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  41.54 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  37.68 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  37.91 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  36.79 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  34.06 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  34.18 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  35.36 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  35.38 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  34.53 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  34.89 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  35.21 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  34.98 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  34.98 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  34.98 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  34.98 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  34.98 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  34.98 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  34.29 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.75 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  34.51 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  35.36 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  35.36 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  33.33 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  30.77 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  38.3 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  32.75 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  33.1 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.75 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  33.81 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  32.33 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  32.62 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  29.12 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  29.78 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 278 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  32.76 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  32.76 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  32.16 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  32.76 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  32.76 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  33.09 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  30.94 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  31.9 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  30.18 
 
 		 280 aa  95.5  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  34.34 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  28.62 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  38.15 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 315 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  28.62 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  31.97 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  31.06 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  36.67 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  29.39 
 
 		 276 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2982  UspA domain-containing protein  34.07 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  36.92 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  40.97 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  28.62 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  30.36 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  30.8 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>