246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1355 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  99.26 
 
 		 270 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  82.01 
 
 		 278 aa  441  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  65.56 
 
 		 270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  60.74 
 
 		 270 aa  301  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  63.7 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  60.22 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  56.36 
 
 		 271 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  53.28 
 
 		 271 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  52.4 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  51.29 
 
 		 271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  49.82 
 
 		 271 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  50 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  50.72 
 
 		 271 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  46.74 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  44.8 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  42.96 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  44.16 
 
 		 270 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  43.53 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  41.52 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  43.8 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  42.91 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  39.42 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  39.27 
 
 		 271 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  36.33 
 
 		 274 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  35.27 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  34.78 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  34.84 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  32.22 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  35.29 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  32.85 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  33.8 
 
 		 279 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  32.51 
 
 		 279 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  32.51 
 
 		 279 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  33.45 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  36.36 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  36.14 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  35.54 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  36.04 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  36.04 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  36.04 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  36.04 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  36.04 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  36.04 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  35.37 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  34.51 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  36.59 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  32.38 
 
 		 278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  35.52 
 
 		 279 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.97 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  45.89 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  41.24 
 
 		 242 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  36.32 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  32.86 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  33.1 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  30.69 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  32.74 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  31.01 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  33.45 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  33.45 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  37.34 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  37.34 
 
 		 286 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  40.39 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  32.98 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  32.03 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  35.33 
 
 		 268 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  41.11 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  39.44 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  44.83 
 
 		 280 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  43.15 
 
 		 286 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 278 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  32.14 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  44.83 
 
 		 280 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  31.18 
 
 		 274 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.04 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.04 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  39.23 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  32.34 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  39.23 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.04 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.04 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  39.52 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  35.87 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  30.48 
 
 		 280 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  32.44 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  31.27 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  36.63 
 
 		 282 aa  92.4  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.94 
 
 		 276 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  29.82 
 
 		 277 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>