179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3434 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  45.26 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  43.27 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  43.82 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  42.91 
 
 		 270 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  42.55 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  42.2 
 
 		 270 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  42.81 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  40.79 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  44.41 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  40.43 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  39.3 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  38.79 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  34.3 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  37.55 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  38.49 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  35.97 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  37.81 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  36.97 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  35.74 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  36.1 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  34.3 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  39.13 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  36.96 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  35.61 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  35.87 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  35.13 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  35.69 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  35.02 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  36.23 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  34.63 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  36.56 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  35.11 
 
 		 279 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.04 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  34.04 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  34.04 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.17 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  31.82 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  32.75 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  32.75 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  41.89 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  32.75 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  32.75 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  32.75 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  32.75 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  32.04 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  32.04 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  32.86 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  29.68 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  28.92 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  29.5 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  29.47 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  30.07 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  30.31 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  31.27 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  31.9 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  29.72 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  29.72 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  29.72 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  29.72 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  29.72 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  31.05 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  30.53 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  30.69 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  28.16 
 
 		 267 aa  95.5  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  31.12 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  33.5 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  28.27 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  36.36 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  28.32 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  33.71 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2982  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  29.12 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  27.97 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  30.1 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  37.71 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  29.5 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  29.33 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.79 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  29.62 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  27.21 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  35.8 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  27.97 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  32.69 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>