186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0266 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 260 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2974  UspA domain-containing protein  49.63 
 
 		 266 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  36.5 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1679  hypothetical protein  36.5 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0785159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  31.54 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  31.54 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  31.54 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  31.54 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  31.54 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  31.54 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.65 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  30.11 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.86 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  32.38 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  31.64 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  37.44 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  32.71 
 
 		 278 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  29.27 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  29.89 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  30.53 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  31.97 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  32.34 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  30.34 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  33.5 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  30.5 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  31.71 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  30.31 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  29.29 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  29.2 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  33.07 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  33.04 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.56 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  33.04 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  31.17 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  35.38 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  39.31 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  30.38 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  32.27 
 
 		 280 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  35.48 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  32.65 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  30.27 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  30.27 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  38.15 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  31.25 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  36.11 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  30.15 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  37.36 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  32.72 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  40 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  31.07 
 
 		 278 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  39.31 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  38.15 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  39.08 
 
 		 286 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  30.27 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  30.27 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  30.27 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  30.27 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  38.51 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  29.15 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  33.18 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  31.79 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  31.79 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  34.9 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  31.23 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  31.18 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  37.87 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  30.32 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  37.84 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  31.34 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  32.84 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  38 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  39.53 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  28.37 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  41.22 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  30.05 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  33.18 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  30.42 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  30.94 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  32.62 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>