270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7779 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  34.1 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  40 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  39.43 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  35.24 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.63 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  44.74 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  38.1 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  37.71 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  30.99 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  31.9 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  37.91 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  41.48 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  36.76 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  34.88 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  32.71 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  33.33 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  40.57 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  34.08 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  40.22 
 
 		 278 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  33.49 
 
 		 278 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  37.85 
 
 		 291 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  40.25 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  30.25 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  41.24 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  41.44 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  34.78 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  34.78 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  41.24 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  35.12 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  30.2 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  35.12 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  35.12 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  35.12 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  35.12 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  35.12 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  33.62 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  43.79 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  30.64 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  40 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  41.44 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  29.48 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  38.42 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  31.33 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  30.73 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  36.67 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  37.37 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 282 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  34.07 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  33.04 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  33.33 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  33.73 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  34.07 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  32.09 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  37.5 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  34.29 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  34.95 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  35.11 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  32.07 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  37.36 
 
 		 279 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  29.6 
 
 		 278 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  37.84 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  35.39 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  38.3 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  36.87 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  36.42 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  35.84 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  31.17 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  35.96 
 
 		 280 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  29.63 
 
 		 281 aa  95.5  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  29.63 
 
 		 281 aa  95.5  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  41.96 
 
 		 270 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 315 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 277 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  37.29 
 
 		 311 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  35.59 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  36.72 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  36.72 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  32.8 
 
 		 277 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  37.78 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 279 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  33.71 
 
 		 275 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  33.33 
 
 		 276 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>