205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1143 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  43.66 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  42.11 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  33 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  34.84 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  33.81 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  34.47 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  33.81 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  33.81 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  33.81 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  33.81 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  33.81 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  33.81 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  35.09 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  34.62 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  37.78 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  32.74 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.54 
 
 		 281 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  35.75 
 
 		 242 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  33.21 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  35.07 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  32.27 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  31.51 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  35.07 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  33.33 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  40.32 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.03 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.03 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.03 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.03 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  31.94 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  30.88 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  30.85 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  31.8 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  31.71 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  39.25 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  33.21 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  32.99 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  33.1 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.98 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  31.77 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  32.04 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  30.9 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  34.21 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  30.47 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  32.99 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  31.21 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  32.4 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  32.77 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  33.21 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  31.79 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  32.64 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  32.51 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  30.56 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  29.62 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  32.16 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  41.21 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  30.14 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  31.03 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  31.03 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  30.14 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  33.46 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  38.2 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  29.62 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  31.32 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  32.16 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  42.67 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  40.4 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  45.58 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  37.71 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  37.71 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  29.76 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  43.24 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  39.31 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  31.99 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 278 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.41 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  28.57 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  35.03 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>