232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3567 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  83.45 
 
 		 284 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  50.7 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  44.68 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  40.07 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  33.81 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  35.31 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  36.55 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  33.68 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  33.91 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  35.17 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  35.17 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  33.92 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  35.17 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  35.17 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  33.8 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  32.4 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  32.4 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  32.4 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  32.4 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  32.4 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  32.4 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  32.87 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  33.56 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  33.56 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  31.79 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  31.43 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  31.12 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  30.45 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  46.67 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  29.82 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  34.15 
 
 		 271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  30.69 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  32.87 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  32.18 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  32.18 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  33.91 
 
 		 270 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  33.65 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  37.04 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  31.51 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  34.02 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  32.64 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  45.33 
 
 		 279 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  32.41 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  42.67 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  29.41 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  29.41 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  38.36 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  36.51 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  33.57 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  28.72 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  31.77 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  35.45 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  38.3 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  31.77 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  44.08 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  32.91 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  31.25 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  34.48 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.62 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  33.8 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  36.65 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  31.44 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 272 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  32.74 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  30.58 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  36.57 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  35.31 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  33.53 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  29.82 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  29.97 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  35.1 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  38.69 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  36.28 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  29.12 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  36.67 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>