212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3508 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  99.3 
 
 		 286 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  86.32 
 
 		 311 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  70.28 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  58.25 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  59.65 
 
 		 286 aa  295  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  57.84 
 
 		 286 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  57.49 
 
 		 286 aa  275  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  51.25 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  45.68 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3888  UspA domain protein  54.14 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0925098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  51.27 
 
 		 280 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  45.88 
 
 		 280 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  43.68 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  35.25 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  37.16 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  44.9 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  36.04 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  33.68 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  44.3 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  43.92 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  30.9 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  43.24 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  40 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  39.68 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  39.49 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  37.71 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  46.1 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  36.41 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  37.93 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 		 279 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  42.48 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  43.33 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  35.81 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  36.45 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  46 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  37.69 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  44.22 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  41.34 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  35.34 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  37.61 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  33.45 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  39.86 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  37.34 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  37.34 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  44.83 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  44.44 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  33.33 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  33.33 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  33.33 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  33.33 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  33.33 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  35.68 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  41.56 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  40 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  43.71 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  33.94 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  41.56 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  40.97 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  36.72 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  42.66 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  40.65 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  39.33 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  34.09 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  37.99 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  31.1 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  39.81 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  32.73 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  41.89 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  42.48 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  37.7 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  41.96 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  42.48 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  41.91 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  37.43 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  36.46 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  37.43 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  31.52 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  39.31 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  38.55 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  39.04 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  38.41 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  38.41 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  34.96 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  38.89 
 
 		 280 aa  95.9  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  37.5 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  30.92 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  39.51 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>