218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1305 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  100 
 
 		 287 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  80.14 
 
 		 287 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  46.44 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  45.39 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  45.76 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  37.37 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.55 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  45.51 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  31.16 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  44.89 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  44.94 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  44.38 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  31 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  37.05 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  38.5 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.31 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  36.99 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  35.45 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  31.08 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  34.12 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  38.07 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  39.67 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  30.23 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  39.79 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  38.29 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  32.61 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  34.68 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  38.8 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  33.33 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  41.71 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  41.71 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  34.16 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  36.21 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  38.2 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  40.68 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  41.08 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  41.08 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  38.64 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1046  UspA domain protein  40.11 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  40.7 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  27.24 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30.18 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  34.46 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  34.27 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  34.41 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  39.33 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  39.89 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  34.41 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  31.65 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  34.27 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  36.87 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  39.31 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  41.42 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  41.42 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  37.29 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  37.99 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  39.31 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  38.55 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  32.37 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  39.24 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  39.89 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 279 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  37.02 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  37.08 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  37.64 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  37.08 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  31.74 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  38.76 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  29.43 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  30.87 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  31.25 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  30.87 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  30.67 
 
 		 279 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  30.87 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  30.87 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  30.87 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  30.87 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  36.72 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  31.02 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0487  ribosomal protein S1  26.94 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.638126  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  37.87 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  36.05 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  40.37 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  37.87 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  35.75 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  32.58 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>