181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0079 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  58.39 
 
 		 286 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  56.61 
 
 		 295 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  45.08 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  36.84 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  42.11 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  37.28 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  39.89 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  37.28 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  31.44 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  33.22 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  29.8 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  30.93 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  34.03 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  30.27 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  36.32 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  31.89 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  28.4 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  30.95 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1046  UspA domain protein  40.54 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  33.52 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  31.94 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  30.69 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  32.84 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  32.84 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  32.29 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  32.84 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  32.84 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  32.81 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  32.81 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  32.81 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  32.81 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  32.81 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  32.81 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  34.27 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  35.08 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  34.25 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  36.16 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  34.57 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  29.66 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  29.79 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  32.8 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  32.8 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  34 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  32.04 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  30.56 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  34.76 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  36.93 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  31.58 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  33.69 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  33.15 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  36.7 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  33.33 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  23.92 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  32.81 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  34.41 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  31.11 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  32.73 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  33.13 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  35.23 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  30.56 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  32.39 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  31.41 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  31.95 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  29.21 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  25.84 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 271 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  25.94 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  30.46 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  28.72 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0828  UspA domain protein  34.46 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0482749 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  29.05 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  32.51 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  28.38 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  32.51 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  28.43 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  31.52 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  33.53 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  29.65 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  36.46 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2647  UspA domain protein  32.43 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2983  UspA domain-containing protein  31.77 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>