225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3129 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  56.36 
 
 		 292 aa  322  6e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  41.36 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  38.53 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  40.12 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  40.7 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  30.33 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  30.43 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  30.85 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  40.33 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  30.82 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  36.51 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  25.42 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  39.77 
 
 		 311 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  28.09 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  39.58 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  38.95 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  36.84 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  36.21 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  29.28 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  33.16 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  27.76 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  27.76 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  27.76 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  27.76 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  27.76 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  27.76 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0954  universal stress protein  23.45 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  36 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  32.34 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  31.56 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1046  UspA domain protein  37.24 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  35.87 
 
 		 278 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  29.43 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  38.15 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  27.67 
 
 		 278 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  37.79 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  33.85 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  31.25 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  36 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  36 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  29.51 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0487  ribosomal protein S1  23.63 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.638126  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0828  UspA domain protein  39.52 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0482749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  31.68 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  32.78 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 280 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  29.18 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  34.66 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  33.95 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  32.04 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  29.78 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  36 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  32.65 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  34.57 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.43 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.43 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.43 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.43 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  30.27 
 
 		 260 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  28.09 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  37.36 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 272 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  25.44 
 
 		 270 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  37.36 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  30.99 
 
 		 264 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  31.76 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  29.19 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  30.9 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.88 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  31.76 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  33.5 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  31.98 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  30.23 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  31.28 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  32.95 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  35.88 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  30.59 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  36.99 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  34.54 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  29.74 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  27.09 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  35.88 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>