251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0954 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0954  universal stress protein  100 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0487  ribosomal protein S1  81.63 
 
 
283 aa  488  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.638126  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  50.18 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0238  universal stress protein  48.77 
 
 
283 aa  280  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  23.45 
 
 
294 aa  99  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  28.09 
 
 
282 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  23.78 
 
 
291 aa  92  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  35.37 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  23.99 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  25.77 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  24.4 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  25.08 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  25 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  27.84 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  23.71 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  34.72 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  26.62 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  27.61 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  27.96 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  23.47 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  23.47 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  25.42 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  25.42 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  24.16 
 
 
278 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  24.15 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  32.62 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  32.62 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  23.91 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  23.91 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  23.39 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  26.87 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  24.08 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  26.14 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  29.1 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  29.1 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  29.1 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  29.1 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  23.55 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  23.57 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  26.7 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  25 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  21.62 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  27.52 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  24.28 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  23.99 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  29.03 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  23.99 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  27.27 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  27.08 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  28.86 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  26.01 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  20.75 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  23.47 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  28.86 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  25.88 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  24.32 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  29.48 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  23.55 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  23.55 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  21.36 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  25.64 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  27.4 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  28.16 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  20.68 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  20.68 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  20.68 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  20.68 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  20.68 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  20.68 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  26.97 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  23.91 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  23.73 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  24.73 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  25.5 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  30.28 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  26.76 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  22.95 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  21.72 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  27.89 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  29.93 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  21.84 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  22.45 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>