200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1256 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0487  ribosomal protein S1  49.12 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.638126  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0954  universal stress protein  50.18 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0238  universal stress protein  46.15 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  23.08 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  25.42 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  27.93 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  25.51 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  25.81 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  27.49 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  26.94 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  26.94 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  23.67 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  25.43 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  26.94 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  26.94 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  25.13 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  27.27 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  25.33 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  29.08 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  25.82 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  26.11 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  24.52 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  25.6 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  25.26 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  24 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  24.71 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  23.74 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  25.4 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  26.24 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  25.52 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0079  UspA domain-containing protein  23.92 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.367855 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  25.53 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  27.59 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  23.41 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  25.67 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  24.71 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  22.81 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  26.92 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  26.9 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  28.98 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  30.81 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  26.63 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  26.32 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  25.11 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  29.45 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  26.29 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  23.67 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  22.97 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  22.65 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  23.98 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  25.4 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  24.2 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  22.22 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  25.7 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  25.46 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  25.46 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  23.91 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  26.52 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  25.89 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  25.38 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  26.57 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  26.28 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  26.06 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  21.46 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  21.46 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  26.59 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  23.74 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  22.22 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  20.44 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  25.29 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  26.21 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  24.64 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  22.07 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  26.9 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  24.71 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  25.32 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  24.86 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  26.26 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  24.58 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  24.37 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  24.4 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  24.37 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1664  UspA domain-containing protein  22.76 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.483104  normal  0.685181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  23.98 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  23.91 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  22.81 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>