182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1733 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  100 
 
 
276 aa  551  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  36.46 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  36.3 
 
 
282 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  33.81 
 
 
284 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  37.63 
 
 
279 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  35.48 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  43.15 
 
 
274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 
279 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  32.07 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  32.85 
 
 
265 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  44.52 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  45.39 
 
 
280 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  46.43 
 
 
280 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  45.83 
 
 
280 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  41.38 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  32.39 
 
 
277 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  45.71 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  37.41 
 
 
278 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  40.69 
 
 
274 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  37.43 
 
 
282 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  37.43 
 
 
282 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  33.1 
 
 
278 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  40.21 
 
 
281 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  39.2 
 
 
291 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  40.21 
 
 
281 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  28.06 
 
 
279 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  38.51 
 
 
281 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
276 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  32.07 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  27.07 
 
 
277 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  31.64 
 
 
260 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  35.67 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  39.31 
 
 
280 aa  99  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  38.61 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  30.36 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  30 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  30 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  30 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  30 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  30 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  30 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  33.56 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  39.2 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 
286 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  44.22 
 
 
286 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  36.02 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  29.64 
 
 
279 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  40.54 
 
 
280 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  33.51 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  44.44 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.83 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.83 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  29.5 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  43.75 
 
 
286 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.83 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.83 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 
272 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  34.27 
 
 
278 aa  92.4  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  38.25 
 
 
278 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  28.41 
 
 
278 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  44.52 
 
 
286 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  45.58 
 
 
286 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  44.52 
 
 
286 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  34.1 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  39.34 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  38.21 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  33.82 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  33.82 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  33.93 
 
 
277 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 
286 aa  89  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  31.49 
 
 
279 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
277 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  35.14 
 
 
277 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  29.5 
 
 
277 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  37.5 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  37.97 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  31.82 
 
 
276 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  37.43 
 
 
276 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2982  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 
279 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  33.78 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  33.91 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  33.91 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  39.35 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  33.96 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  35.59 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  38.1 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  33.15 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  29.5 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  29.64 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  29.09 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>