174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4215 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  553  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  46.45 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 291 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  38.3 
 
 		 279 aa  191  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  36.52 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  36.79 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  28.83 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  31.96 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  30.42 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  35.24 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  43.92 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  28.28 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  35.58 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  29.27 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  27.37 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  32.39 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  41.89 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  43.71 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  28.63 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  29.47 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  42.86 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  33.15 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  32.64 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  34.59 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  34.21 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  36.36 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  38.41 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  28.85 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  30.95 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  35.42 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  36.55 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  37.76 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  26.84 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  36.88 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  34.22 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  29.17 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  29.24 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  36.02 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  29.17 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  34.27 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  32.78 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  36.42 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  36.42 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  36.42 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  36.42 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  34.65 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  33.96 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  38.12 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  35.71 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  30.91 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  37.93 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  31.84 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  33.15 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  34.93 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  35.15 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  31.69 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  38.67 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  34.91 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  33.54 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  33.54 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  35.37 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  35.95 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  35.95 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  34.46 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  35.86 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  33.11 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  33.1 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  28.1 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  28.24 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  37.67 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  36.05 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  27.52 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  33.11 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>