167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3366 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  536  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  55.64 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  56.02 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  53.79 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2564  universal stress protein, UspA  39.36 
 
 		 189 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  31.77 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  32.49 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  32.39 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  33.46 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  31.76 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  30.42 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  30.88 
 
 		 276 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 272 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  31.41 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  34.57 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  32.26 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  35.02 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  29.67 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  29.34 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  28.85 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  27.6 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  29.53 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  29.93 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  33.99 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  35.9 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  35.9 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  35.9 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  35.9 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  30.8 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  29.37 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  32.31 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  32.23 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  32.09 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  31.75 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  30.05 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  33.53 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  33.77 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  29.47 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.17 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  30.91 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  28.16 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  30.8 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  32.7 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  33.94 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  28.27 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  30.94 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  30.22 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  28.62 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  28.62 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  28.62 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  28.62 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  28.62 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  28.62 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  27.64 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.07 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  30.5 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  26.02 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  38.14 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  30 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  30 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  36.36 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  31.27 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  33.75 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  31.78 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  28.83 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  31.21 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  35.42 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  29.59 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  30 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  28.62 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  29.8 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  34.72 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  33.73 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  32.77 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  28.31 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  29.27 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  35.83 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  28.41 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  29.35 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  27.11 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>