118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2564 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2564  universal stress protein, UspA  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  41.18 
 
 		 267 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  39.36 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  39.56 
 
 		 274 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  38.89 
 
 		 268 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  31.89 
 
 		 271 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  31.67 
 
 		 271 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  30.56 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  31.67 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  30.81 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  32.02 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 		 272 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  33.51 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  31.94 
 
 		 274 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  27.81 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  29.89 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  28.89 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  30.29 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  29.67 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  30.34 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  30.34 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  30.85 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  28.96 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  32.4 
 
 		 268 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  27.87 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  28.96 
 
 		 274 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  37.29 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  29.05 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  28.25 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  29.31 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  31.1 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  28.96 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  29.55 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  28.81 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  32.63 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  28.65 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  31.82 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  29.32 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  29.47 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  29.32 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  29.32 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  26.14 
 
 		 277 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 279 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  32.48 
 
 		 279 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  26.7 
 
 		 277 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 		 280 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  31.33 
 
 		 281 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  31.09 
 
 		 315 aa  52  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 279 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  33.04 
 
 		 279 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  28.04 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  30.25 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 		 277 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  30.18 
 
 		 287 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 279 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  29.34 
 
 		 274 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  29.41 
 
 		 287 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  24.43 
 
 		 277 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  29.02 
 
 		 279 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  27.91 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  25.93 
 
 		 278 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  29.2 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  26.71 
 
 		 279 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  28 
 
 		 279 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  27.27 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  27.83 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  26.97 
 
 		 280 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  27.16 
 
 		 287 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  27.91 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  28.07 
 
 		 278 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  27.22 
 
 		 276 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  27.91 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  24.8 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 286 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  27.6 
 
 		 286 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  26.19 
 
 		 282 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  30.36 
 
 		 286 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  26.06 
 
 		 284 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  28.65 
 
 		 277 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  26.09 
 
 		 267 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  30.86 
 
 		 279 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  30.86 
 
 		 279 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  30.86 
 
 		 279 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  30.86 
 
 		 279 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  30.86 
 
 		 279 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  30.86 
 
 		 279 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  24.23 
 
 		 282 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 278 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 		 276 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>