204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2897 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  100 
 
 
270 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  36.47 
 
 
276 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  36.16 
 
 
276 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  40.94 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  31.79 
 
 
291 aa  95.5  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  34.66 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 
292 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  38.5 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  43.38 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  25.44 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  33.49 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  42.65 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  29.59 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  37.08 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  40.44 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  30.15 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  35.75 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.65 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  32.02 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  33.52 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  32.02 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  39.52 
 
 
274 aa  82  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  27.53 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  31.82 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  40.58 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  40.58 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  29.47 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  29.47 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  31.33 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  34.43 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  32.96 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  28.47 
 
 
278 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  33.15 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  38.67 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  34.25 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  30.06 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  42.65 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  31.58 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  29.21 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  38.69 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  30.04 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  34 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  36.36 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  42.06 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  32.37 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  32.18 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  32 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  30.46 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  31.35 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  31.79 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  34.07 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  33.9 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  39.2 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  28.18 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  29.31 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  27.02 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  35.14 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  34.86 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  26.39 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  32 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  39.34 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  31.64 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  31.11 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  32.02 
 
 
282 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 
286 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  28.74 
 
 
287 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  32.02 
 
 
282 aa  72  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  37.1 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  28.74 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  31.46 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  27.43 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  36.64 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0954  universal stress protein  30.83 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  28.92 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  28.92 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  28.57 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  38.1 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  39.37 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  36.29 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  28.92 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  28.92 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  28.92 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  28.92 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  37.24 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  32.96 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  35.15 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  32.26 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>