174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0687 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  34.28 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  32.27 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  32.27 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  30.5 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  30.14 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  30.14 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  30.14 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  30.14 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  30.14 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  30.14 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  30.71 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  29.89 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  30.36 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  30.42 
 
 		 282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  27.96 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  30.5 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  30.04 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  30.58 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  30.1 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  29.18 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  29.51 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  30.5 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  28.42 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  28.42 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  28.42 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  28.42 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  30.47 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  32.75 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  38.46 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  38.46 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  30.73 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  30.77 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  27.97 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  28.68 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  27.44 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  32.46 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  28.72 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  29.35 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  32.22 
 
 		 282 aa  89  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  26.41 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  34.07 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  31.79 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 271 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  26.64 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  36.09 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  25.68 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  26.55 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  27.24 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  34.62 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  28.42 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  27.92 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  24.73 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  26.9 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  32.21 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  26.01 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  31.13 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  27.72 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  23.67 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  24.74 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  33.8 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2982  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0756  universal stress protein  29.35 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  35.33 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  27.49 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  26.22 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  27.65 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  29.79 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  31.82 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  26.74 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  26.62 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  27.86 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  26.42 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  31.11 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  26.5 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  26.37 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  29.35 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  32.79 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.79 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  34.07 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  35.66 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  27.17 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>