214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3504 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  97.2 
 
 		 286 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  74.48 
 
 		 286 aa  394  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3888  UspA domain protein  84.47 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0925098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  73.08 
 
 		 286 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  57.84 
 
 		 286 aa  295  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  58.19 
 
 		 286 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  57.84 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  59.65 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  51.25 
 
 		 279 aa  262  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  50.54 
 
 		 280 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  51.25 
 
 		 280 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  52.71 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  48.03 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  42.45 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  34.04 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  34.51 
 
 		 274 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  42.61 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  32.65 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  34.16 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  35.59 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  35.62 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  33.7 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  38.46 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  39.33 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  33.81 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  39.2 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  40.34 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  40 
 
 		 242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  36.9 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  40.98 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  42.26 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.01 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  37.66 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  40 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  40.22 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  29.9 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  37.64 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  38.26 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  46.81 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  33.63 
 
 		 277 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  42.47 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  35.83 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  35.59 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  36.16 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  37.87 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  36.7 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  44.22 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  33.51 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  34.7 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  33.18 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  31.46 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  36.57 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  32.31 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  32.31 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  36.93 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  36.76 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  32.31 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  32.31 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  32.31 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  32.31 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  33.79 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  36.76 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  34.87 
 
 		 272 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  40.94 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  36.27 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  35.39 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  43.36 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  34.04 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  42.11 
 
 		 280 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  38 
 
 		 278 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  40.14 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  41.01 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  37.57 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  32.94 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  38.12 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  31.65 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  36.16 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 281 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  39.46 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  39.46 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  37.91 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  39.46 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  39.46 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  37.5 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>