178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1367 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  79.71 
 
 		 274 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  77.34 
 
 		 278 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  61.45 
 
 		 274 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  52.88 
 
 		 278 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  52.71 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  38.27 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  38.27 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  40.21 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  35.61 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  38.49 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  35.84 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  39.72 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  38.68 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  38.33 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  39.16 
 
 		 270 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  41.37 
 
 		 271 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  37.91 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  38.43 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  37.94 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  35.87 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  36.82 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  36.52 
 
 		 271 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  35.66 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  32.85 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  35.56 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  34.29 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  32.85 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  32.73 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  31.91 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  32.12 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  30.32 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  31.07 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  33.1 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.73 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  32.26 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  32.26 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  32.97 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  30.32 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  32.62 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  30.07 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  32.18 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  32.18 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  32.18 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  32.18 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  30.71 
 
 		 276 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  34.4 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  33.17 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  29.97 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  33.09 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.74 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  30.36 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  28.52 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  29.08 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  31.4 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  37.72 
 
 		 280 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  31.09 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  40.44 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  30.25 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  27.02 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  26.83 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  28.37 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  28.37 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  28.37 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  28.37 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  28.37 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  28.37 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  34.66 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  32.13 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  30.05 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  35.46 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  30.56 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  34.43 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  26.64 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  38.13 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  26.37 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  36.88 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  40.71 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  26.64 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  37.85 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  27.65 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>