188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3883 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  100 
 
 		 270 aa  534  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  85.19 
 
 		 270 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  84.44 
 
 		 270 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  65.93 
 
 		 269 aa  349  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  67.78 
 
 		 270 aa  348  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  65.93 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  49.64 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  47.27 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  46.64 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  44.24 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  44.84 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  42.65 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  40.43 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  43.8 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  42.2 
 
 		 275 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  40.14 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  41.07 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  42.91 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  46.95 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  44.41 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  43.32 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  41.88 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  42.16 
 
 		 277 aa  175  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  42.91 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  43.07 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  42.49 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  39.57 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  42.51 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  38.43 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  38.71 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  37.14 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  38.38 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  39.16 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  36.59 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.11 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  36.19 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  33.9 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  34.47 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  34.03 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  32.63 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  32.29 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  32.29 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  35.02 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  35.02 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  30.67 
 
 		 281 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  35.02 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  35.02 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  35.02 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  35.02 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  33.67 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  34.52 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  38.86 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  32.97 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  33.33 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  29.93 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.58 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  40.83 
 
 		 291 aa  99  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2982  UspA domain-containing protein  38.2 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  29.62 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  30.88 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  39.52 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.38 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  31.36 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  31.21 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  28.63 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.68 
 
 		 278 aa  95.5  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  37.16 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  31.56 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  31.05 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  34.4 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  34.4 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  34.4 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  34.46 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  34.4 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  34.4 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  37.24 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  28.67 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  37.24 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  38.1 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  38.3 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  30.69 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  39.01 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  37.14 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  35.35 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  33.78 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  35.88 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  34.23 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  33.78 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  32.4 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>