174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4723 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  77.34 
 
 		 276 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  76.26 
 
 		 274 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  59.93 
 
 		 274 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  55 
 
 		 278 aa  314  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  50.9 
 
 		 277 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  37.99 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  37.86 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  37.86 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  38.08 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  38.79 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  37.89 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  38.71 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  35.97 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  35.46 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  38.43 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  39.07 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  34.64 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  36.65 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  36.79 
 
 		 271 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  33.94 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  37.99 
 
 		 271 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  34.89 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  32.96 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  32.22 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  33.69 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  31.91 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  30.99 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  32.08 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  30.71 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  32.63 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  30.11 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  30.11 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  31.22 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  30.58 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  31.29 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  31.29 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  30.18 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  31.16 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.76 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  31.9 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  31.9 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  31.9 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  31.9 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  32.16 
 
 		 281 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  32.38 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  30.04 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  31.31 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  28.83 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  30.56 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  30.99 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  30.27 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  28.28 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 277 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  30.99 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  30.99 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  30.99 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  30.99 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  30.99 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  30.99 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  29.82 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  29.62 
 
 		 279 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  33.11 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  29.64 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1679  hypothetical protein  36.49 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0785159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  27.15 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  26.06 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  30.55 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  33.78 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  29.96 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.58 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  27.17 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  26.88 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  28.87 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  33.77 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  37.68 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30.24 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  36.96 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  35.54 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  32.24 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  28.5 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0954  universal stress protein  25 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>