178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2982 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2982  UspA domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.53 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  35.89 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  29.97 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  32.3 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
270 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
269 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  30.24 
 
 
279 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  30.24 
 
 
279 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  30.24 
 
 
279 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  30.24 
 
 
279 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  30.24 
 
 
279 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  30.24 
 
 
279 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 
270 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  30.24 
 
 
279 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  33.1 
 
 
270 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 
271 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 
277 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  32.06 
 
 
270 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  32.87 
 
 
270 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  28.9 
 
 
279 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  29.27 
 
 
279 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  31.68 
 
 
279 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30.53 
 
 
274 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 
279 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  32.88 
 
 
271 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 
276 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  32.16 
 
 
272 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  29.41 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  29.41 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  31.67 
 
 
279 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  33.08 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  27.57 
 
 
279 aa  99.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  32.81 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  31.12 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  29.08 
 
 
274 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  31.91 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  30.74 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  32.65 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  29.97 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  28.9 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  28.43 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 
313 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  29.01 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  31.03 
 
 
278 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  36.02 
 
 
308 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 
277 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  43.24 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  32.88 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  32.14 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  28.67 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  30.21 
 
 
274 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  32.08 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  44.76 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  33.96 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 
270 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  38.95 
 
 
280 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  33.92 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  30.66 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  29.59 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  32.07 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 
270 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  35.23 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  31.53 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  29.77 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  30.15 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  29.77 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  29.77 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  29.77 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  32.02 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  32.34 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  28.09 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  31.37 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  31.2 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  30.56 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
272 aa  89  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  29.12 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  30.7 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  29.27 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.03 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  25.52 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  35.76 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  35.38 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  28.01 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.56 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  37.14 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  27.78 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  37.84 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  32.86 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  28.15 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>