205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3435 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  100 
 
 		 278 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  62.72 
 
 		 279 aa  357  9e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  61.87 
 
 		 279 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  36.52 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  38.99 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  35.31 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  34.52 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  33.69 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  34.03 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  35.58 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  34.81 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  34.15 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  34.83 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  34.83 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  34.03 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  34.83 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  34.83 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  34.83 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  34.83 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  32.94 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  31.72 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  31.72 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  45 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.22 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  35.15 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  38.03 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  32.51 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  33.67 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  35.75 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  31.94 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.72 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  32.59 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  38.84 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  32.16 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  30.28 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  32.96 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  33.33 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  33.21 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  33.46 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  37.64 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  33.69 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  34.78 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  37.7 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  35.35 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  32.86 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  35.35 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  38.27 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  34.03 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  37.56 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  31 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  39.68 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  32.87 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  37.22 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  34.47 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  37.22 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  32.87 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  35.1 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  35.1 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  35.1 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  35.1 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  39.61 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  32.99 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  34.48 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  32.32 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  38.33 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  33.21 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  32.91 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  34.65 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  38.2 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  30.85 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  37.04 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.07 
 
 		 280 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  38.25 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  34.87 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  36.56 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  39.22 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  30.36 
 
 		 280 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  33.94 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  43.92 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  34.7 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  36 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  34.73 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  38.86 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  28.41 
 
 		 276 aa  92.4  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  30.8 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  34.07 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  29.5 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  33.89 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  33.89 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>