205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1135 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  71.07 
 
 		 278 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  62.01 
 
 		 278 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  62.01 
 
 		 278 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  62.01 
 
 		 279 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  62.01 
 
 		 279 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  60.22 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  59.5 
 
 		 277 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  58.42 
 
 		 277 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  57.35 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  54.29 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  57.19 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  57.4 
 
 		 275 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0756  universal stress protein  58.13 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  42.91 
 
 		 278 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  40.48 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  42.29 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  42.2 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  42.36 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  40.56 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  41.84 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  41.84 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  39.5 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  39.5 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  41.84 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  41.03 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  41.84 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  41.84 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  41.84 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  40.78 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  39.93 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  40.07 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  37.72 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 308 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  37.19 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  37.5 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  37.72 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  36.68 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  36.77 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  36.92 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  38.93 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  34.86 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.23 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  33.45 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  33.8 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  36.04 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  34.64 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  35.17 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  39.65 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  36.68 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  35.11 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  32.14 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  35.89 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  36.3 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  33.59 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  33.1 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  36.3 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  35.56 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  33.21 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  33.69 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  32.73 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  32.39 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  32.86 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  34.15 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  35.05 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.01 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  36.49 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  31.93 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  42.2 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  30.38 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  37.21 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.79 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  33.45 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  38.16 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  29.75 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  34.72 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  34.59 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  37.23 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  34.52 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  36.61 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  37.56 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  33.57 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>