236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4518 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  100 
 
 		 282 aa  567  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  42.96 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  39.93 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  38.38 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  36.75 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  36.75 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  38.19 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  37.28 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  38.25 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  37.76 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  37.76 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  37.76 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  37.76 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  36.97 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  35.54 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  35.86 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  35.86 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  34.63 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  35.86 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  35.86 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  35.86 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  35.86 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  37.19 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.04 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  34.03 
 
 		 281 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  34.15 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  35.34 
 
 		 278 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  31.72 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  33.78 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  34.15 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  30.42 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  39.67 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  33.8 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  33.22 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  33.45 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  32.62 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 313 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  35.47 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  34.96 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  32.63 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  30.32 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  32.29 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  31.14 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  32.06 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  31.58 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  30.8 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  38.33 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  36.67 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  37.57 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  31.27 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  40.88 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  34.25 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  35.09 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0756  universal stress protein  34.22 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  35.33 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  31.44 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  39.39 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  39.39 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  30.04 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  30.48 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  40.13 
 
 		 280 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  31.72 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  34.09 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  29.47 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  37.82 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  37.78 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  36.32 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  33.89 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  27.82 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  34.09 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4215  UspA domain-containing protein  35.24 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  29.33 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  28.32 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  39.11 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 286 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  30.66 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  35 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  30.34 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0954  universal stress protein  28.09 
 
 		 283 aa  93.2  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  33.68 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>