253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6312 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  100 
 
 		 281 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  85.77 
 
 		 278 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  72.24 
 
 		 278 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  63.48 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  63.83 
 
 		 279 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  62.41 
 
 		 279 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  62.41 
 
 		 279 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  62.41 
 
 		 279 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  62.41 
 
 		 279 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  62.41 
 
 		 279 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  62.41 
 
 		 279 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  62.06 
 
 		 279 aa  355  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  62.41 
 
 		 279 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  56.38 
 
 		 279 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  56.54 
 
 		 279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  43.62 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  40.99 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  45.99 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  43.01 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  43.01 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  42.66 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  41.58 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  42.76 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  41.58 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  41.24 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  43.26 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  42.36 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  40 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  38.57 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  41.13 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  41.13 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  41.13 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  41.13 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  38.93 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  37.76 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  43.01 
 
 		 278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  36.43 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  35.81 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  34.92 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  38.38 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  33.89 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  34.98 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  33.92 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  34.48 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 		 308 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  33.57 
 
 		 277 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  38.64 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  34.4 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  34.03 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  33.1 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  33.33 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  37.46 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  32.39 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  34.47 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  34.14 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  34.14 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  34.71 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  35.44 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  48.99 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  33.9 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  36.64 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  48.99 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  45 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  46.98 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  41.67 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 270 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  33.8 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  33.81 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  33.81 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  42.5 
 
 		 279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  35.96 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  36.14 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  33.22 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  32.63 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  32.63 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  32.54 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  33.22 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  35.09 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  36.46 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  32.87 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  32.76 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  31.71 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  36.76 
 
 		 242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  32.17 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  33.67 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  43.33 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0266  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  0.123671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  34.03 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  38.43 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>