192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1592 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  100 
 
 
280 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  93.93 
 
 
280 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  56.38 
 
 
279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  47.14 
 
 
280 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  34.93 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  34.63 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
277 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  34.63 
 
 
281 aa  158  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  34.63 
 
 
281 aa  158  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
277 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
277 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  34.92 
 
 
281 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
276 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  36.27 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
279 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  35.02 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  35.02 
 
 
274 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 
277 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  36.46 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  34.47 
 
 
279 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  33.79 
 
 
279 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  33.79 
 
 
279 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  32.2 
 
 
278 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  33.79 
 
 
279 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  33.79 
 
 
279 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  33.79 
 
 
279 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  33.79 
 
 
279 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  35.35 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  32.98 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  35.31 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  35.31 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  35.31 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  35.31 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 
279 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  32.97 
 
 
265 aa  132  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  29.76 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  29.76 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  32.99 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  31.51 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.8 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
279 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
278 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  32.03 
 
 
277 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 
279 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  31.25 
 
 
264 aa  122  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  34.43 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  34.15 
 
 
277 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  32.35 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  33.33 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  31.68 
 
 
271 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  32.17 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  37.88 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 
271 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  39.66 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  32.31 
 
 
271 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  31.14 
 
 
278 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  31.58 
 
 
270 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  31.56 
 
 
276 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 
270 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 
270 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  30.53 
 
 
271 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  35.63 
 
 
277 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  31.34 
 
 
279 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  30.14 
 
 
270 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
270 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  32.78 
 
 
291 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  32.4 
 
 
270 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 
279 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 
287 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  29.47 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  37.67 
 
 
278 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  33.17 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 
272 aa  99  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  30.88 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  28.11 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  30.99 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1314  UspA domain-containing protein  29.24 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  30.36 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  29.86 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  30.39 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  34.09 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  29.18 
 
 
269 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  31.07 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  32.63 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  30.45 
 
 
272 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  36.31 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  32.56 
 
 
271 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3018  UspA domain-containing protein  31.53 
 
 
277 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  28.26 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  40.54 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  27.97 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.406558 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>