More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4566 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  74.55 
 
 		 279 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  50.54 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  41.99 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  43.51 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  40.64 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  40.64 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  40.64 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  40.64 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  40.64 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  40.64 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  42.7 
 
 		 279 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  40.21 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  43.01 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  41.99 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  42.61 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  41.2 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  41.28 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  41.64 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  38.35 
 
 		 278 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  40.93 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  39.5 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  40.28 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  36.92 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.93 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  36.75 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  35.36 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  35.36 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  35.36 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  35.36 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  36.65 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  36.75 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  37.2 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  34.6 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  34.78 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  36.52 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  34.6 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  34.06 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  29.76 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  44.13 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.01 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  36.08 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  33.82 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  33.68 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  30.96 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  33.68 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  32.86 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  32.73 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  34.51 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  32.97 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  32.51 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  34.04 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  32.27 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  35.69 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  34.74 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  29.37 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  32.04 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  33.93 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  34.26 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  34.49 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  35.46 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  32.75 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  35.36 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  30.96 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  34.84 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  29.86 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  30.8 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.93 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  35.07 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  32.29 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  29.41 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  32.06 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  31.95 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  34.78 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  31.16 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  38.74 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  40.26 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  35.35 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  33.22 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  32.04 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  36.98 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  32.26 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>