230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1133 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  68.82 
 
 
279 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  57.35 
 
 
279 aa  331  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  56.99 
 
 
279 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  56.99 
 
 
279 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  56.99 
 
 
279 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  56.99 
 
 
279 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  56.99 
 
 
279 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  56.99 
 
 
279 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  57.71 
 
 
278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  55.91 
 
 
279 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  56.63 
 
 
278 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  55.2 
 
 
279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  56.54 
 
 
281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  54.12 
 
 
279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  42.86 
 
 
279 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  41.99 
 
 
279 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  41.99 
 
 
279 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  44.64 
 
 
278 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  41.94 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  40.21 
 
 
276 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  41.94 
 
 
278 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  41.94 
 
 
278 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  41.94 
 
 
279 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  41.94 
 
 
279 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  40 
 
 
279 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  40.48 
 
 
277 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  40 
 
 
277 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  40 
 
 
277 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  40.57 
 
 
275 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 
277 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  40.5 
 
 
278 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  36.14 
 
 
282 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
276 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  36.4 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  31.8 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  35.36 
 
 
271 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  34.83 
 
 
280 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  35.42 
 
 
274 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
277 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  34.83 
 
 
274 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  31.82 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  33.89 
 
 
280 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  34.13 
 
 
280 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  34.41 
 
 
271 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  32.86 
 
 
264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  37.28 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  35.69 
 
 
280 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  34.49 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  34.46 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  34.03 
 
 
284 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  36.4 
 
 
271 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  34.04 
 
 
274 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  33.81 
 
 
265 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  42.78 
 
 
271 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  31.63 
 
 
277 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 
308 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  32.19 
 
 
278 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  31.25 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0756  universal stress protein  37.88 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  34.14 
 
 
276 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  34.03 
 
 
284 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  42.37 
 
 
277 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  32.32 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  34.41 
 
 
271 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  38.38 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  38.25 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  31.32 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  32.44 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  41.34 
 
 
280 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  35.19 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0687  UspA domain protein  30.36 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  35.11 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
269 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  30.74 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  34.74 
 
 
271 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  34.25 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  33.1 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  37.64 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  38.2 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  29.87 
 
 
281 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  38.04 
 
 
280 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  29.87 
 
 
281 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  32.51 
 
 
270 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  38.59 
 
 
280 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  31.72 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  31.72 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30.9 
 
 
277 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  31.15 
 
 
315 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  46.59 
 
 
271 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  29.08 
 
 
273 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>